SSIはServer Side Includeの略で、HTMLファイルの中にＳＳＩコマンドを記述し、サーバーに処理させる仕組みです。詳しくはとほほのＷＷＷ入門のＳＳＩの項などで見てください。

　ＳＳＩに関しては、サーバーの環境よってサポートされる内容が大きく異なります。ですので、自分の利用するサーバーの情報をしっかり押さえておく必要があります。

　トクトクに関しては、次に説明する情報さえしっかり押さえておけば、大丈夫でしょう。

• トップページのＳＳＩが動作しません。
• ＳＳＩに引数が渡りません。
• ＳＳＩでエラーになります。

　トクトクでは、ＳＳＩを動作させるにはファイルの拡張子を .shtml にしなければいけません。
　.htaccess もトクトクでは動作しませんのでこれは変更不可能です。
　また、トップページは index.htm , index.html の形式しか許されていませんので、トップページにＳＳＩを利用することはできません。

　一番初めのページにＳＳＩを利用したい場合はトップページから
<META HTTP-EQUIV='Refresh' CONTENT='0;HREF=index.shtml'>
などを利用してジャンプさせるようにするしかありません。
（当然のことながら、この場合はreferer情報などは取れなくなります）

ＳＳＩでどのような書式が使えるかは、サーバー環境によって異なります。
トクトクでは以下のとおりです。

動作	書式	ＨＴＴＰヘッダー
○	<!--#exec cgi="xxx.cgi"-->	必要
×	<!--#exec cgi="xxx.cgi arg1 arg2"-->	−−
×	<!--#exec cgi="xxx.cgi?arg1+arg2"-->	−−
○	<!--#exec cmd="xxx.cgi"-->	不要
×	<!--#exec cmd="xxx.cgi arg1 arg2"-->	−−
○	<!--#include file="xxx.cgi"-->	必要
×	<!--#include file="xxx.cgi arg1 arg2"-->	−−
○	<!--#include virtual="xxx.cgi"-->	必要
○	<!--#include virtual="xxx.cgi?arg1+arg2"-->	必要

ＣＧＩに引数を渡す時には、#include virtual を使いましょう。

また、<!--#include virtual="xxx.cgi?arg1+arg2"--> の場合、ＣＧＩ実行時に参照可能な各変数の値は以下のようになります

変数	値
$ARGV[0]	arg1
$ARGV[1]	arg2
$ENV{QUERY_STRING}	arg1+arg2

※#exec cmd 形式で呼び出す仕様のＣＧＩを #include virtual 形式で呼び出す為には、HTTPヘッダーを出力するように改造する必要があります。
　大抵の場合、２行めに次の一行を追加するだけで大丈夫でしょう。

print "Content-Type: text/plain\n\n"; # HTTPヘッダーの出力

1. ＳＳＩの対象ファイルへのパスはあってますか？
2. 拡張子はトクトクで使用可能なものですか？
   ＳＳＩの動作構造上、インクルード/実行されるファイルは「HTTP的」に解釈されるので(#exec cmdを除く)、トクトクで使用を許されていない拡張子を使用した場合にはエラーになります。
   参照：トクトクで使用可能な拡張子
3. HTTPヘッダーは出力されていますか？
   実行するＣＧＩはHTTPヘッダーを出力する仕様になっていますか？
   呼びだし形式とHTTPヘッダーの必要性の対応は前項を参照してください。